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Table 2 Distribution of the pks+ strains according to sequence type (ST.)

From: Genomic characterization of Escherichia coli with a polyketide synthase (pks) island isolated from ulcerative colitis patients

ST

Phylogroup

Total

A

B1

B2

D

F

UC patients (n = 13)

12

  

4

  

4

73

  

3

  

3

95

  

2

  

2

127

  

2

  

2

141

  

1

  

1

8303

  

1

  

1

Downloaded genomes (n = 158)

12

  

8

  

8

14

  

2

  

2

38

   

1

 

1

73

  

47

  

47

80

  

1

  

1

95

  

36

  

36

104

  

1

  

1

109

 

1

   

1

127

  

24

  

24

141

  

6

  

6

278

 

1

   

1

392

 

2

   

2

416

  

1

  

1

537

  

1

  

1

550

  

1

  

1

643

  

1

  

1

969

  

1

  

1

998

  

11

  

11

1193

  

1

  

1

1231

  

1

  

1

1262

  

2

  

2

1278

  

1

  

1

2604

  

1

  

1

6134

  

1

  

1

7010

1

    

1

10,522

  

1

  

1

Unknown

  

2

 

1

3

Total

1

4

164

1

1

171

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BMC Genomics

ISSN: 1471-2164

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